2011年醫藥指數大跌31%，僅12月就大跌14%，經過一年的大幅調整，醫藥板塊絕對估值水平處于歷史底部。部分醫藥行業證券分析師認為，“十二五”時期全面取消“以藥補醫”，行業增速未來可能放緩，但醫藥企業的成長性不會改變，政策風暴后將誕生更強大的制藥企業，堅守成長股。

衛生部部長陳竺1月5日指出，“十二五”時期要全面取消以藥補醫，醫藥政策雪上加霜，于是再次瓦解了市場對醫藥股的信心，引發空頭繼續殺跌。國泰君安認為，取消“以藥補醫”，意味著靠著高回扣空間打入醫院終端的處方藥企業銷量下降。但對于醫療體制的改革，可以說，這在全世界范圍內都是一個幾乎無解的難題。即使在更為黑暗的2005-2006年那場醫藥政策風暴后，還是有大量優質的醫藥企業生存下來，之后又啟動了2009-2010年的醫藥大牛市。

國泰君安認為，除了藥品降價之外，對基層藥物招標制度，總額預付費制度，按病種付費制度等也是近期市場擔心的醫藥政策。但以強勁增長的需求帶動的醫藥行業健康成長不會改變，優秀醫藥企業會在困局中成功突圍，研發創新、并購擴張，風暴過后，將誕生更為完美的中國制藥巨頭。

國信證券預計醫藥行業增速在未來3年放緩，但這是相對過去3年新醫改補欠式投入拉動下的較高增長而言的放緩：雖趨向溫和但仍平穩增長15%以上。政策面沒有變得更差，最壞的影響已體現在2011年，醫保控費和普藥招標價格螺旋式下降也已在市場預期之內。國信證券跟蹤的重點省份最新招標動態顯示并未比預期更差。

國信證券建議在政策擾動之下堅持三條主線選擇投資標的。一是擁有獨家品種、獨特資源、品牌消費類公司，這類公司價格堅挺、成本壓力不大，優選天士力(600535)、云南白藥(000538)、東阿阿膠(000423)、中恒集團(600252)、康美藥業(600518)；二是專注于高端治療和預防領域，這類公司競爭相對不激烈，優選海正藥業(600267)、恒瑞醫藥(600276)、華東醫藥(000963)、雙鷺藥業(002038)、人福醫藥(600079)；三是工商一體龍頭或醫療服務類公司，比如華東醫藥、一致藥業。

國泰君安建議在2012年持續關注具有創新能力和國際化視野的恒瑞醫藥、萊美藥業(300006)、人福醫藥；在中藥領域關注具有獨特資源和實力的東阿阿膠、天士力、云南白藥、康美藥業；在發生醫療消費結構性變化中，高速成長的醫療器械領域，關注宏達高科(002144)，魚躍醫療(002223)；在深刻變革的醫院產業關注愛爾眼科(300015)、開元投資(000516)所做的努力開拓；以及在醞釀變局的血液制品行業中關注華蘭生物(002007)、上海萊士(002252)。

東方證券表示，在動態市盈率處于歷史底部，行業利潤增速有望向上的趨勢下，看好2012年醫藥板塊優選標的走勢，其中化藥領域建議關注恒瑞醫藥、雙鷺藥業、華東醫藥、通化東寶(600867)、一致藥業、人福醫藥和恩華藥業(002262)等，醫療服務領域建議關注愛爾眼科，通策醫療(600763)和迪安診斷(300244)、特色原料藥領域建議關注海正藥業、海翔藥業(002099)和華海藥業(600521)、中藥領域建議關注康美藥業，天士力、江中藥業(600750)、上海凱寶(300039)、昆明制藥(600422)和紅日藥業(300026)等，醫藥大健康領域建議關注云南白藥、湯臣倍健(300146)和山大華特(000915)等。

光大證券(601788)認為醫藥股在完成補跌后價值初現，3、4月或有行情，建議“超配”醫藥。堅持三個原則：把握政策變化中的確定性東西，醫療服務和保健，中藥板塊；把握超跌和主題投資的交易性機會，關注十二五規劃；選擇成長和拐點公司進攻，關注年報預增，送配、季報行情，白馬股做基本配置。